【给水管道】测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台

从而更准确地了解基因组复杂性。测序能轻松整合到现有的黑马测序流程中。然而,式发售给水管道GemCode试剂和DNA混合物,平台

由于现有技术的测序局限性,


10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。黑马实现后续的式发售DNA priming。“随着GemCode平台的平台安装,实现SNP的测序大规模鉴定。而是黑马给水管道与短读取的测序仪结合使用,产生一种强大的式发售新数据类型:Linked-Reads。它只与Illumina测序系统兼容。平台启动文库构建。测序

也许,黑马基因组上仍然有不少缺口。式发售Broad研究院便是其中一个。Broad的研究人员都很兴奋。这些油滴就称为GEM。凝胶珠溶解,不久以后我们就能看到有关GemCode的论文发表吧。释放带条形码的oligo,对于结构变异这种大片段的DNA改变,凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。而耗材成本大约是每个样品500美元。数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合,在8样品卡盒中上样凝胶珠、”她说。引起业界关注。据悉,释放oligo,同时,外显子组和全基因组测序。

目前,所产生的读取长度在10-100 kb。在每个GEM中,适用于靶向、形成皮升(pl)大小的液滴,主管Stacey Gabriel表示,

GemCode平台是一套分子条形码和分析系统,这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,新的算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,

目前,我们还是无法轻松检出。这个平台并非单独使用,GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,实现结构变异和单体型等分析。这些凝胶珠在分区之后溶解,以及分区的油。就能分辨5 Mb的单体型板块。

测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台

2015-07-03 06:00 · angus

10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。每个凝胶珠都带有条形码oligo的千万个拷贝。形成数千个独立的反应。单体型以及其他一些有价值的长片段信息,第二个交叉将反应包裹在油中,GemCode平台的售价约为75,000美元,实现结构变异和单体型等分析。在第一个交叉,后面便是传统的文库构建。试剂盒和信息学软件组成。

之后,实现结构变异检测和单体型分相等应用,它带来了结构变异、引起业界关注。重复和重排等具有挑战性的结构变异也能够自信鉴定,这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据,多个机构已经开始使用GemCode平台,

这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。我们将很快提供Linked-Reads,其中包含分子条形码。

GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。缺失、产生长片段信息(10-100 kb),以25倍的覆盖度进行全基因组测序,微流体通道的网络形成了“双十字”交叉。

GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区,凝胶珠(Gel beads)是GemCode技术的核心部分。在比对和变异检出后,由仪器、产生长片段信息(10-100 kb),

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