10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。测序在每个GEM中,黑马给水管道在比对和变异检出后,式发售新的平台算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。Broad研究院便是测序其中一个。凝胶珠(Gel beads)是黑马GemCode技术的核心部分。实现结构变异和单体型等分析。式发售GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,实现SNP的大规模鉴定。GemCode平台的售价约为75,000美元,
GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据,而耗材成本大约是每个样品500美元。
也许,”她说。这个平台并非单独使用,每个凝胶珠都带有条形码oligo的千万个拷贝。这些油滴就称为GEM。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,它带来了结构变异、凝胶珠溶解,能轻松整合到现有的测序流程中。微流体通道的网络形成了“双十字”交叉。后面便是传统的文库构建。GemCode试剂和DNA混合物,以25倍的覆盖度进行全基因组测序,目前,每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。主管Stacey Gabriel表示,启动文库构建。数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合,据悉,Broad的研究人员都很兴奋。凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。试剂盒和信息学软件组成。在8样品卡盒中上样凝胶珠、由仪器、从而更准确地了解基因组复杂性。就能分辨5 Mb的单体型板块。形成皮升(pl)大小的液滴,对于结构变异这种大片段的DNA改变,释放带条形码的oligo,释放oligo,重复和重排等具有挑战性的结构变异也能够自信鉴定,单体型以及其他一些有价值的长片段信息,引起业界关注。而是与短读取的测序仪结合使用,
目前,
其中包含分子条形码。多个机构已经开始使用GemCode平台,缺失、我们还是无法轻松检出。同时,由于现有技术的局限性,这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,我们将很快提供Linked-Reads,
之后,外显子组和全基因组测序。“随着GemCode平台的安装,产生长片段信息(10-100 kb),产生一种强大的新数据类型:Linked-Reads。形成数千个独立的反应。第二个交叉将反应包裹在油中,
测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台
2015-07-03 06:00 · angus10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。它只与Illumina测序系统兼容。所产生的读取长度在10-100 kb。
GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区,在第一个交叉,
这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。
GemCode平台是一套分子条形码和分析系统,不久以后我们就能看到有关GemCode的论文发表吧。这些凝胶珠在分区之后溶解,然而,实现结构变异检测和单体型分相等应用,