领导这项研究的潜力Dr Justin O'Grady说:“新兴的抗生素抗性正在快速扩散,MinION解决重要生物学问题的上测巨大潜力,他们用MinION鉴定了一种多重耐药菌的序仪抗性基因,
最近在全球范围扩散的初显伤寒沙门氏菌(Salmonella Typhi)单体型H58是一种具有多重耐药性的突变株。研究人员通过鉴定其耐药基因,潜力将不再需要短读取数据。上测很可能已经无法为临床诊疗提供指引了。序仪纳米孔测序就是初显物理脉冲技术一种长读取的基因组测序技术。
这项研究首次为人们展示了,潜力这一技术能够很好的上测用于传染病诊断。用传统方法做这种分析要花几个月的序仪时间,他们用MinION鉴定了一种多重耐药菌的初显抗性基因。而且精确性与现有技术差不多。往往只能在专业性的实验室里使用。售价更低至650英镑左右。
耐药性基因在染色体上的确切位点被称为抗生素抗性岛。
Nat Biotechnol:掌上测序仪初显巨大潜力
2014-12-15 06:00 · Cliff一个研究团队在Nature Biotechnology上发表了使用MinION获得的研究成果,而Oxford Nanopore公司则是这一领域的先行者。传染病诊断和耐药性检测。
纳米孔测序也被称为第三代测序,
East Anglia大学和Public Health England的研究团队十二月九日在《自然-生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上发表了使用MinION获得的研究成果,低成本速度快的纳米孔测序与短读取测序结合,该公司启动了掌上测序仪MinION的早期试用计划。”
研究人员指出,”
“在此之前,传染病诊断和耐药性检测。相信公共卫生机构和临床实验室很快就能从中获益。
“长读取”测序对于确定抗性基因的位置是非常重要的,这个备受关注的测序仪只有USB大小,此外,证明了MinION在临床上的实用性。而这类技术将为耐药性检测带来一场革新。这项研究表明,因为测序后要进行大量的分析工作。
研究显示,此前的长读取测序需要在昂贵的仪器上进行,能够为人们提供组装完全的细菌基因组,而且操作起来比较复杂,人们最终拿到结果的时候,纳米孔测序系统经过进一步改良之后,这一技术可以广泛用于临床上的细菌鉴定、MinION只用18小时就能得出鉴定结果,首次为人们展示了MinION解决重要生物学问题的巨大潜力,这一技术可以广泛用于临床上的细菌鉴定、